EMC v2.12以降では、Universal CRT(KB2999226)がインストールされていない場合に、インストール時にUniversal CRTをインストールする動作となります。
しかしながら、対象マシンでWindows Updateサービス、Windows Modules Installerサービスが無効になっている場合、該当のパッケージのインストールができずEMCのインストールも失敗します。
Windows Updateサービス、Windows Modules Installerサービスが無効になっている場合、これらのサービスを有効にしてから再度EMCのインストールをお試しください。
万一、これらのサービスを開始した状態で事象が再現する場合、お手数ですが、KB2999226を手動でインストールした上で、改めてEMCのインストールをお試しください。
KB2999226は以下のマイクロソフト社のサイトよりダウンロード可能です。
https://support.microsoft.com/ja-jp/help/2999226/update-for-universal-c-runtime-in-windows
なお、このUniversal CRT(KB2999226)は、Windows Server 2016は適用対象となっていないため、
本事象はWindows Server 2016では発生しないものと考えられます。