上記FAQの通り、EMCではクライアントをMACアドレスで識別しているため、MACアドレスが重複する場合、複数のクライアントが1台で表示されてしまう場合があります。 その場合、別途GMAC機能を有効にして、MACアドレスを元にした擬似的な値でクライアントを識別するようにしてください。GMACの使用法は以下のFAQをご参照ください。
MACアドレスの登録仕様について教えてください

なお、上記FAQの通り、AMCではクライアントをMACアドレスのみで識別していないため、MACアドレス重複の回避は必須ではなく、GMAC機能も必要ありません。基本的にコンピュータ名を変更していただければ、複数のクライアントが1台で表示されてしまう問題は発生しません。

マスタからの再構成などの度にクライアントが複数台に重複表示されてしまう場合は、識別子がその度に新たに作成されていることになります。古いクライアントについては、下記FAQの通り、EMC/AMCのクライアント一覧上から削除していただいて問題ありません。
EMCのクライアント一覧に重複したクライアントが存在しますが、どうすれば良いですか
AMCのクライアント一覧に重複したクライアントが存在しますが、どうすれば良いですか

もし自動削除したい場合は、EMCの場合は以下のFAQをご参照ください。
クライアント自動削除機能の使用方法を教えてください
AMCの場合はカスタマーサイトより「FFRI AMC オペレーションマニュアル」をご参照ください。

上記の自動削除は、指定の期間が経過した非接続クライアントを削除する機能となります。そのため、ある一定期間は古いクライアントが表示されたままとなり、ライセンスも消費されたままになります。そちらを回避したい場合は「名寄せ」機能がありますが、本機能はいくつかの注意事項がございますので、ご利用の前に必ずカスタマーサイトより「FFRI AMC オペレーションマニュアル」または「FFRI Enterprise Management Console 運用マニュアル」の「名寄せ」の項目をご参照ください。